温室大棚蔬菜要增施有机肥，有机肥料能改善土壤结构，丰富土壤微生物，增加土壤保肥、供肥、畜水能力。而且要以基肥为主，每亩施腐熟有机肥5000公斤，便于日后的生产管理，减轻或避免棚内土壤次生盐渍化的危害。在使用化肥时，要注意深施，一次施肥不要过量。在棚内决不允许化肥面施。掌握上述施肥原则后，生产者可根据作物的种类，不同的生长阶段和个体生长情况进行追肥。如在低温季节追肥，应选在晴天中午，追肥以后要通风1~2小时，直到叶子上的水干。有条件的地方，可以进行二氧化碳施肥以增加产量。
大棚蔬菜的灌水以滴灌较好，不但可以节水，而且可以降低棚内湿度。若没有滴灌设施，也可以浇灌或沟灌。在低温季节尽量不要沟灌，浇灌也须在晴天中午进行，浇灌后开棚通风，最好灌水与追肥结合进行。如果棚内土壤很干，确实需要沟灌的，要在持续晴好天气后才可沟灌。沟灌时，水不能淹没畦面。
