日光温室环境常处于密闭条件下，温度高，湿度大，特别是不受雨淋；而且为了获得较高收获，经常种植相同的作物，连续施用大量同样肥料，形成高度连作的栽培方式。这样土壤性质常发生很大变化，其中一些已严重影响蔬菜生产，有必要采取合理的措施进行调控，以利作物正常生长。
大棚建设土壤中既有病原菌、又有固氮菌等有益生物。在露地生产的情况下，这些微生物保持一定的平衡。而在保护地条件下多年连作时，由于蔬菜作物的根系分泌物质和病株残叶，造成土壤生物条件失去原有平衡，使得病原菌繁殖迅速，减弱肥分的有效化过程，病害日趋严重，影响作物产量。现将日光温室中土壤生物条件的控制方法介绍如下：
1、换土。选适宜的时间彻底换土。
2、药剂消毒。⑴40%甲醛。先将土壤翻松，将药液喷于土壤表面，然后再翻耕一次，用塑料薄膜盖地面，2天之后打开薄膜，经2周后才能进入室内作业；⑵硫磺粉。利用硫磺粉在播种前或定植前2--3天进行熏蒸。具体做法是：每1000立方米的棚室内，用硫磺粉和锯末各半，放在整个花盆内分散几处，然后点烯成烟雾状。熏蒸时要密闭温室、大棚，一昼夜即可；⑶氯化苦。对防治线虫有效。在床土10厘米深土层处，注入药剂，然后用塑料薄膜覆盖7天(夏季)或10天(冬季)。熏蒸结束后，将塑料薄膜打开放风10天(夏季)或30天(冬季)，待刺激消失后才可使用。
采用上述药剂处理时，要保持土壤温度15--20℃以上，这样药剂容易气化，达到消毒目的。使用后应密闭保护地，以提高药效。
3、蒸汽消毒。先翻耕地，用一种特制的橡胶布覆盖地面,四周用重物压住使其密闭，然后向橡胶布内通入2个大气压的132℃的蒸汽，处理8小时，这样0--30厘米土房内的温度达到50-90℃。消毒比较彻底，但成本较高。
4、塑料薄膜地面覆盖。在夏季炎热季节，将塑料薄膜覆盖在整平的土地上,四周用土块盖住，密闭覆盖1个月，能达到很好的消毒效果。但夏季多雨地区不能使用。
5、实行轮作。在尽可能的条件下，实行两种以上的作物轮作,以抑制病原菌的繁殖和生长，减轻病虫的发生。
