冬棚辣椒育苗期间，往往会突然受到寒流的袭击，温度骤然降低，秧苗容易受冻害。秧苗受冻害的轻重，还与低温过后气温回升的快慢有关。如果升温和解冻太快，秧苗组织易脱水干枯，造成死苗。大棚建设辣椒苗防冻措施有以下四个方面：
改进方法：利用人工控温育苗方法，如电热温床和工厂化育苗等，是解决秧苗受冻问题的根本措施。
增强秧苗抗寒力，避免秧苗徒长：在寒流来临前尽量揭去覆盖物，让苗多照光和接受锻炼。在雨雪低温期间，尽量利用天气放晴间隙，揭掉草苫，让辣椒苗能受到阳光照射。雨雪停后骤然转晴时，中午前后在苗床上盖几张草苫，避免秧苗失水萎蔫。床土湿度大，秧苗易受冻害，所以寒潮来临前要控制苗床浇水，床土过湿的可撒一层干草木灰。
平衡施肥： 增施磷钾肥，苗期使用抗寒剂。秧苗喷施0.5~1%的红糖或葡萄糖溶液，可增强抗寒力。在3~4叶期喷施2次（间隔7天）0.5%的氯化钙溶液，增强抗寒性。
保温防冻：寒潮期间严密覆盖苗床。进行短时间通风换气时，要防止冷风直接吹入床内伤苗。夜晚要加盖草帘。可将稻草枯叶撒在秧苗上，寒潮过后再清除。苗床上盖的草苫应干燥。在下雪天，雪停后，及时将雪清除出育苗场地。
