据调查，辣椒死棵主要发生在两个时间：一是秋末冬初，即秋冬茬辣椒定植后到初果期，二是在春季，3、4 月份发病严重。 死棵严重时，几乎天天都有发病明显的植株。除了病原菌侵染引起发病外，北方温室与栽培环境和一些操作习惯也有很大的关系。
1 受病害侵染
引起辣椒死棵的病菌原主要 有2 类 ：一类是细菌侵染引起的 ，主要是细菌性青枯病；另一类是真菌侵染引起的，在苗期和定植初期主要有猝倒病、立枯病、疫病和茎基腐病，成株期主要有疫病、根腐病、枯萎病和菌核病等。
2 栽培管理原因
（1） 重茬栽培 重茬栽培使土壤中病原菌基数增多，尤其是温室大棚设施的相对固定和连年重茬种植，使土壤酸化、碱化、盐渍化程度越来越高，土壤中病残体数量逐年增多，病原菌不断积累，加之温室大棚内高温高湿的环境条件又适宜病害发生，病菌从根部或茎基部伤口侵入植株后繁殖危害，在北方温室适宜的条件下传播蔓延，造成死棵大面积发生。
（2） 种子带菌 种子带菌是病害远距离传播的主要途径，也是新菜田发病的初侵染源。 播种前不注意对种子进行消毒处理，也给病害发展蔓延带了有的条件。
